La SEM  se posicionará en el ámbito local y nacional como una organización motora del desarrollo de la Microbiología para contribuir con el avance del país en las áreas específicas relacionadas con esta ciencia. Se enfocará en la realización de un diagnóstico, a nivel nacional,  sobre las líneas de trabajo relacionado con el servicio y la investigación. Articulará con la academia y otras organizaciones o empresas para aunar esfuerzos en trabajos colaborativos en el área de interés. Fortalecerá el intercambio del conocimiento científico, del área entre sus miembros, a través de la realización de foros o conferencias virtuales con la participación de sus socios de invitados de la ALAM u otras instituciones, vinculando a todos los participantes, mediante teleconferencia.

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